SMU е създадена, когато министърът на висшето образование и обучение, д-р Blade Nzimande, по смисъла на член 20 от Закона за висшето образование от 1997 г. (Закон 101 от 1997 г.) обнародва Sefako Makgatho Health Sciences University (SMU) в Държавен вестник на SA №: 37658 от 16 май 2014 г.
Обнародването последва съобщението, направено през 2011 г. от министър Nzimande, когато той обяви намерението си да отдели кампуса Medunsa от университета в Limpopo. Намерението на министъра се основава на констатациите и препоръките на работния екип, създадени и ръководени от проф. Малегапуру Макгоба, бивш заместник-ректор на Университета на Ква-Зулу Натал (UKZN) и д-р Макс Прайс, заместник-ректор на университета в Кейптаун (UCT).